以往东海的各个海军分部都是直接听命于海军本部的指挥，各个海军分部之间并不存在直属关系，各个海军分部的长官的军衔都是海军上校。
但是现在东海的海军结构却是变成集权式结构，东海海军的最终指挥权落在了罗格镇海军基地的手里。
也就是说，罗格镇海军基地已然成为了东海海军的总部，而这个总部的最高领导，毫无疑问便是林奇这位海军本部中将了。
林奇还对东海的海军建制进行了一系列地位重组，按照伟大航道上海军本部的模式，林奇设立了一个军队统帅，三个海军高层将领。
艾斯德斯作为曾经的帝国将军，军事才能卓越，领兵打仗本来就是她的老本行，管理军队，稳定军心，艾斯德斯都比林奇更加在行，所以林奇直接把东海海军统帅的位置给了她。
林奇则是退居二线，只作为名义上的最高首领，但却不插手任何的军队管理和任务安排。
海军统帅给了艾斯德斯，而剩下的三大将领林奇则是给了卡尔、赤瞳和霍斯金。
卡尔作为罗格镇海军基地一直以来的长官，在东海的威望非常的高，东海的这些势力大多都是他联系拉拢过来的。
卡尔功不可没且能力也十分突出，所以林奇给他安排了一个仅此于艾斯德斯的位置，并让他管理着东海海军内部的人事管理和各项的统筹工作。
赤瞳则是因为实力突出，是林奇身边现在的最高战力之一，所以给她安排了这样一个职位。也不需要她管理什么事情，主要就是震慑作用，让别人知道，林奇手下的三大将领的厉害。
而霍斯金作为一个经验丰富的大海贼，他那丰富的只知识阅历就是林奇最看重的东西。
所以林奇把东海海军学院的院长的位置让给了他，让他去教书育人，不用他上场战斗。
为了凸显东海海军学院的重要性，林奇就也给了霍斯金一个仅次于艾斯德斯的位置，让人们知道他对东海海军学院的重视。
而除了霍斯金，被林奇安排进东海海军学院的还有巨人萨乌罗、古伊娜、希尔、玛茵和蕾欧娜等人。
他们分别教授东海海军学院的学员们不同的知识和能力，培养东海下一代的精英。
一帅三将之后，便是一些具体的部门管理职位了，组建一个新的海军势力，所有的部门分支都是要齐全的。
比如说是监狱，以前东海抓捕的海贼，上不了台面的就归东海处理了，而一些有名头的大海贼，却是要送到海军本部进行审判关押的。
所以现在既然林奇想独立出海军本部的体系了，那么一个属于东海的海军大监狱也是必不可少的了。
而这座新建的海军监狱，林奇则是交给了小萨蒂这个虐待狂，由于其喜欢刑讯拷打，这正好适合她的口味，只是以后监狱里的罪犯怕是要遭殃了。
另外，塞琉·尤比基塔斯被林奇安排在了罗格镇，成为罗格镇警备队的队长，管理着罗格镇的治安问题，这也正好和她以前的工作差不多。
林奇的发小哈特被林奇安排到了艾斯德斯的手下，和他的老船长巴克一起为艾斯德斯做事，管理训练东海的海军士兵们。
而一直赋闲在家的贝尔梅尔这次也被林奇拉了出来，让她管理起了东海海军的后勤工作。
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