随后另外的男人赶到，在伊森·本堂的尸体边一直喊着“本堂”，紧接着，疑似琴酒和伏特加的两人抵达现场，这个男人也自杀身亡。
这样一来，如果水无怜奈真的是本堂瑛祐的姐姐，那就意味着她亲手杀死了自己的亲生父亲。
随后，在后续调查中，他们又发现水无怜奈曾在直播画面中提到过自己是AB型血，而本堂瑛祐本人是O型血。
这让柯南认为这两人应该不是亲姐弟，进而怀疑水无怜奈可能是组织的人假扮的。
不过，在听到本堂瑛祐声称自己体内流淌的是姐姐的血后，枫原便提出有可能是白血病导致血型变化。
以此为调查方向，他们得知本堂瑛祐确实做过白血病手术，她的姐姐捐献了骨髓，最终他们还是确认了水无怜奈是CIA的一员。
接下来，就是要把水无怜奈还回去。
组织的人也一直在利用本堂瑛祐寻找疑似因车祸而昏迷住院的水无怜奈。
为了瞒过组织，避免水无怜奈的真实身份暴露给组织，枫原、柯南和赤井秀一商量了一下，并在与水无怜奈进行沟通后，决定卖个破绽，成功地让琴酒等人把水无怜奈给劫了回去。
这之后，琴酒因为不信任水无怜奈，要求她谎称反叛组织诱杀赤井秀一。
这也在他们意料之中。
之后，成功与姐姐相认的本堂瑛祐也决定前往美国留学，想要像爸爸和姐姐那样加入CIA。
事情差不多就此到一段落。
这天，又是下雨的一天。
从早上开始这雨就连绵不绝。
每当组织成员出现的时候，天气似乎都不怎么样…总有种今天也会如此的预感…
枫原心里想着，背着书包和小学生们前往元太的鞋柜处，一起查看里面有没有委托信。
“里面什么都没有…”朝自己鞋子里掏了掏的元太有些郁闷。
“今天的委托也是零啊…”
“真无聊耶…”
“不过，这样不也说明生活很和平吗？”灰原哀说道。
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